假设父获取生父基因沦为孩子生父的可能性和随机男人获取生父基因沦为孩子生父的可能性的比值叫做亲权指数（ paternity index,PI ）。前一种可能性假设为 X; 后一种可能性假设为 Y。

上例中的假设父 2 基因型为 24/25 谓之合子，他获取生父基因 FGA-25 的可能性为 1/2 ，即 X=1/2。随机男人获取生父基因 FGA-25 的机会为该基因的频率，即 Y=0.0958。因此，此例的 PI 值为 0.5/0.0958=5.22。

如果假设父 2 的确是孩子的生父，则不论检测多少位点，皆会回避他与孩子的亲生关系，在所有检测的位点，每一个位点就可以计算出来出有一个 PI 值，多个位点的总计 PI 值相等各个位点 PI 值的乘积，但前提条件是所检测的各位点之间没遗传连锁关系。三联体基因型人组的可概括为三条原则： （ 1 ）当假设父为纯合子时， X=1 ；假设父为杂合子时， X=1/2 ，但杂合子假设父的 2 个基因皆有可能是生父基因时， X=1。（ 2 ）只牵涉到 1 个生父基因时， Y 值相等生父基因的频率。（ 3 ）若牵涉到 2 个生父基因时， Y 值为 2 个生父基因频率之和。

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